В собаководстве популяцией можно назвать как породу в целом, так и определенную ее часть, проживающую на территории определенной страны, области, района и т.д.
Гетерогенная популяция – искусственно созданная стая на базе линий одной породы животных.
«Замкнутая популяция» – группа особей, спаривающихся только друг с другом (разведение в себе).
Исходная популяция – исходный селекционный материал, с которым ведется целенаправленная племенная работа.

Воздействия (мутации, дрейф генов, эффект основателя, миграции) на популяцию приводят к исчезновению стационарности состояния. Частота генов может меняться от введения в популяцию собак других кровей. При этом изменение частоты уже имеющегося в популяции гена будет зависеть от исходной частоты гена, частоты этого гена у вводимых особей и доли популяции, представленной вводимыми собаками.
Влияет на частоту генов и так называемый дрейф генов. Его проявление связано с численностью популяции; в малочисленной популяции увеличивается фактор случайности в распределении отдельных генотипов. Некоторые гены могут вообще исчезнуть из генофонда в связи с отбраковкой их носителей, к тому же распределение генов в популяции может оказаться неравномерным. Увеличение численности популяции, например, из-за всплеска рождаемости в отдельном питомнике, большого количества вязок одного конкретного производителя или в силу иных причин, зачастую приводит к изменению сложившегося распределения генотипов и быстрому возрастанию частоты отдельных генотипов.

Дрейф генов связан с тем, что только часть генотипов/особей в популяции участвует в процессе размножения.
Дрейф генов – это случайное повышение частоты какого-то аллея в результате нескольких совпадающих событий, имеющих стохастический характер (непродуманная вязка с производителем по титулам, изолированный питомник, наследование потомками патологических генов, снова непродуманные вязки этих потомков). Дрейф генов характерен для редко встречающихся признаков (или болезней), которые не отметаются отбором, из-за него патологические гены могут долго сохраняться в роду или в небольшой по размеру популяции, особенно в небольшой популяция из 500–1000 особей, в которой практически отсутствует миграция.

Эффект основателя – закрепление и распространение в популяции какой-то характерной особенности, имевшейся у одного из основателей популяции. В результате действия эффекта основателя и дрейфа генов популяция может оказаться совсем непохожей на ту, от которой она ранее отделилась.

Приведем гипотетический пример с ввозом в Россию новой породы собак. Завозят 5–6 особей, а через несколько лет создается собственная популяция данной породы. В этой новой дочерней популяции, попавшей в нашу страну, генотип будет резко отличаться от родительской исходной популяции, оставшейся за рубежом. К тому времени, когда новая популяция в нашей стране будет переживать расцвет в ней будут гены, характерные для ввезенных в страну 5-6 индивидов, а вовсе не для исходной популяции.
Теперь пример, касающийся выведения новой породы: после скрещивания нескольких пород формируется породная группа, которая состоит из 6–10 животных, отвечающих требованиям и стандарту новой породы (Черный терьер, Московская сторожевая) и затем племенная работа ведется уже только с этими особями без прилития других пород собак. Таким образом, мы берем за основу породную группу из 10 собак и формируем поголовье (популяцию) на основе их генотипа. Теперь представьте, что произойдет, если хотя бы один из данных животных будет носителем рецессивного аномального гена Z. Уже через 3–4 поколения частота этого гена будет достаточно высока и распространение в популяции достаточно обширным.

Попробую еще пример привести: привезли в страну производителя у которого рецессивный признак - красные глаза-)) конечно с ним повяжут не все заводчики своих собак, но представим что он хорош по экстерьеру, а так же мы знаем что рецессивный признак проявляется не в каждом поколении - следовательно сразу мы его не обнаружим.
Теперь нужна помощь математиков - за год этот производитель повязал 10 сук - родилось 60 щенков. Через три года щенков уже будет - 180, будут складываться пары из его детей. Через 4-5 лет возможность встречи двух носителей этого гена уже есть. Что мы получаем? В результате мы имеем через пять лет породную группу собак пораженную признаком "красные глаза" -и мы уже практически не можем избавиться от этого признака - потому что поражена большая часть поголовья - нам приходится только контролировать НОСИТЕЛЕЙ.
А все начиналось с одного красивого производителя.