Начал использовать профессиональный инструмент разработчика: систему контроля версий.
Чем хорошо:
1. Можно будет в любой момент вернуть состояние скриптов назад, отменив любые сделаные изменения.
2. Можно будет работать над движком в кооперации с другими людьми (было бы только с кем).

А еще, там надо фиксировать каждое изменение и описывать его текстом.
Я подумал, зачем этой информации пропадать в глубинах сервера. И решил организовать её автоматическую публикацию.
http://breedportal.com/about/devhistory/ — вот оно.

Т.е. когда я буду что-либо менять, на той странице будет появляться новая строчка с описанием. Что исправил, что поправил, а что и вовсе удалил.